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/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3262.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  3KB  |  43 lines
  1.        Document 3262
  2.  DOCN  M94A3262
  3.  TI    The V3 region of HIV-1 isolates prevalent in Taiwan contains a unique
  4.        signature pattern in addition to the Thailand E subtype sequence.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Chen YM; Sheu TT; Lee CM; Jang YJ; AIDS Research Center, National
  7.        Yang-Ming Medical College, Taipei,; Taiwan, R.O.C.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):116 (abstract no. PA0083). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369313
  10.  AB    OBJECTIVE: To study the genetic variation of the V3 region in the env
  11.        gene from HIV-1-infected persons in Taiwan. To conduct phylogenetic
  12.        analyses of the Taiwanese HIV-1 isolates. METHODS: HIV-1 proviral DNA
  13.        was PCR amplified using nested primers flanking the V3 domain and then
  14.        sequenced. The nucleotide sequences and predicted amino acid sequences
  15.        were analyzed using PHYLIP program (Phylogeny Inference Package).
  16.        RESULTS: Our studies have demonstrated: (i) 18 of 22 (82%) HIV-1
  17.        isolates from Taiwan belong to the subtype E, with 91% nucleotide
  18.        sequence homology with Thailand E subtype (THA E); (ii) there is an
  19.        average of 8% diversity of the V3 loop amino acid sequences in Taiwanese
  20.        subtype E HIV-1 (TWN E), and the difference of V3 loop amino acid
  21.        sequences between the prototypic TWN E (HIV-1-920027) and THA E strains
  22.        is 21%; (iii) in addition to the THA-E sequence as the backbone, the V3
  23.        region of TWN E also contains a unique signature pattern; (iv) instead
  24.        of having GPGQ at the crown of the V3 loop of the THA E, the TWN E
  25.        strains contain GPGR motif; and (v) the amino acid residues 307-309 of
  26.        THA E strains V3 loop have changed from SNN to YN in all the TWN E
  27.        isolates. DISCUSSIONS AND CONCLUSIONS: The predominant HIV-1 strains
  28.        identified in Taiwan during the 1993 and early 1994 period appear to
  29.        have evolved from subtype E in Thailand. The limited genetic variation
  30.        among different TWN E isolates from persons with different risk factors
  31.        also suggests the recent introduction of the subtype E epidemic to
  32.        Taiwan.
  33.  DE    Amino Acid Sequence  DNA, Viral/GENETICS  Genes, env  Human  HIV
  34.        Envelope Protein gp120/*GENETICS  HIV Infections/MICROBIOLOGY
  35.        HIV-1/CLASSIFICATION/*GENETICS/*ISOLATION & PURIF  Molecular Sequence
  36.        Data  Peptide Fragments/*GENETICS  Phylogeny  Polymerase Chain Reaction
  37.        Proviruses/GENETICS  Sequence Homology, Amino Acid  Species Specificity
  38.        Taiwan  Thailand  Variation (Genetics)  MEETING ABSTRACT
  39.  
  40.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  41.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  42.  
  43.